亮發光桿菌是一大類具有高 GC 含量基因組(約 70%)、產生菌絲體和孢子的革蘭氏陽性細菌。已報道的大多數鏈霉菌的環型質粒通常較小 (8−14 kb), 包括滾環復制的質粒(如 pIJ101、 pSG5、pJV1、pSN22、pSVH1、pSB24.2、pSY10、 pSNA1、pSLG33 和 pEN2701 等)和染色體整合/自主游離復制的質粒(如 SLP1 和 pSAM2 等)。在不同細菌中滾環復制的質粒均含有復制起始 Rep 蛋白, 雙鏈起始位點和單鏈起始位點, 復制的分子機制基本相同。
鏈霉菌整合/游離型質粒含有 λ 噬菌體類似的 int (整合)和 xis (切離) 位點, 可以位點特異地整合到染色體上; 當游離存在時, pSAM2 可以進行滾環復制, 而 SLP1 可能進行 Theta 型復制。細菌 Theta 型復制的質粒可以分為單向和雙向復制, 復制蛋白、復制原點以及調控方式具有多樣性, 而鏈霉菌 Theta 型復制的質粒報道較少。與大多數其它細菌不同的是, 利用脈沖場凝膠電泳技術, 在鏈霉菌中檢測到線型結構的染色體和質粒, 在少數鏈霉菌菌株中檢測到多個線型質粒。
已報道的鏈霉菌線型質粒的大小從 12 kb 到 1 800 kb, 它們的端粒包含從 44 bp 到 180 kb 的倒轉重復序列。鏈霉菌線型染色體和線型質粒雙鏈 DNA 的 5′端被末端蛋白共價結合, 而 3′端為游離末端。近年來, 隨著亮發光桿菌大片段 DNA 檢測技術的發展, 大的環型質粒(常為 Theta 型復制, 如 SCP2、pFP11、pZL12、pFP4 和 pSV1 等)的分離和復制的研究進展較快, 一些大質粒上發現了完整功能的噬菌體片段。隨著高通量 DNA 測序技術的普及應用, 過去難以開展的質粒的進化及其分子機理的研究得以進行。本文重點綜述鏈霉菌大的環型質粒和線型質粒的復制, 還將探討環型、線型質粒與噬菌體的進化關系。
規格: ≥97% Punicalagin *: 安石榴苷
規格: ≥98% Anwuligan *: 安五脂素
規格: ≥98% Baccatin III *: 巴卡丁III
規格: 95% plumbapin *: 白花丹醌(白花丹素)
亮發光桿菌
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